当前位置：网站首页>TASSEL软件导入plink格式文件报错

TASSEL软件导入plink格式文件报错

之前介绍过Excel的SNP数据（Excel格式的SNP数据怎么变为plink格式），转为plink的方法，如果要导入plink格式中，会报错：

报错：显示超过区间

problem: string index out of range: 30 file

因为plink编码的是AA TT的格式，变为A A T T的格式才可以。

报错的plink数据：可以看到GG CC两个是连续的。

用--recode处理一下，变为test再进行读取：

plink --file file --recode --out test

查看正确的plink格式：

使用TASSEL读取：

读取成功：

搞定！！！

版权声明
本文为[育种数据分析之放飞自我]所创，转载请带上原文链接，感谢
https://yijiaobani.blog.csdn.net/article/details/124944748