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【流式细胞仪软件】上海道宁为您带来FCS Express,让您轻松缩小流式细胞术和结果之间的差距

2022-08-11 11:50:00 51component技术交流

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FCS Express是一个

完全集成的分析、统计、图表和报告工具

用于获取结果

 

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FCS Express使用集成的电子表格

因此您的图表和统计数据

会随着您的门的变化而更新

所有图形都以高分辨率

直接导出到PowerPoint

轻松地从分析转移到可发布的结果

 

 

一、开发商介绍

De Novo Software自1998年以来一直在开发流式细胞仪数据分析解决方案。在过去的20多年中,FCS Express已成为世界知名的强大且易于使用的数据分析应用程序。

 

De Novo Software在实施数据分析解决方案方面拥有丰富的经验,包括流式细胞术和图像细胞术相关领域。

 

十多年来,De Novo Software 一直为关注结果质量的实验室提供流式细胞仪数据分析解决方案。迄今为止,全球拥有数百家医院和临床参考实验室分析数千个患者病例。

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二、FCS Express功能

FCS Express流式细胞术和图像细胞术软件专注于将您的流式细胞术和图像细胞术数据转化为结果。

FCS Express使您能够使用行业领先的工具进行快速数据分析、创建可发布的图、提供高级门控工具等。通过直接导出到PowerPoint、PDF、Excel、Word和高分辨率图像格式,更快地获得结果。

01、出版质量图形

无需使用多个软件包来呈现您的数据

使用其他软件包生成高质量的图形和报告来传达您的结果可能很困难,并且可能涉及使用许多不同的图像编辑工具。

当您准备好发布和展示您的数据时,FCS Express可以支持以高达750 DPI的分辨率直接将高分辨率导出为PowerPoint、PDF和六种图像格式。

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02、灵活的绘图格式

FCS Express具有从流式细胞仪分析到发布所需的可视化

直观地传达您的结果是任何分析、报告或出版物的一个重要方面。使用其他流式细胞仪分析软件包,研究人员倾向于严重依赖外部软件工具来准备他们的图表和图表以供演示和出版。

使用 FCS Express,您可以直接在软件中轻松自定义绘图的各个方面,从而获得分析期间所需的可视化效果。

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03、批量处理

只需单击一下即可为多个文件创建多个分析文档!

交流是科学的关键,今天的研究人员需要能够快速轻松地导出结果,通常是多种不同的格式。FCS Express中的批处理使您可以通过各种导出模式和文件类型快速轻松地报告和共享您的结果。点击运行,为您的所有样本创建图像、PDF、PPT、XLS等。同时直接导出到您的LIS/LIMS。

04、高内涵分析

FCS Express为您提供从板到单电池的服务

在处理以基于板的格式采集的流式或图像细胞仪数据时,可能难以在板、孔和单细胞水平之间移动,并且通常可能需要许多软件包来执行高内容工作流程中的特定任务。

借助FCS Express中的高含量插件,您可以使用流式或图像细胞仪数据集以任何尺寸的板格式工作,以快速分析许多板、大量样品,并在需要时深入到单细胞水平。

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05、自定义报告

令牌是来自您的分析的实时更新文本、统计数据和系统信息

确保您的分析得到正确注释并组织您的统计数据对所有科学家来说都至关重要。

FCS Express 允许您在分析中的任何位置插入名为 Tokens 的实时更新文本。它们可以显示绘图统计信息、文件关键字、门和布局属性,甚至来自您的计算机的系统信息。代币将加快您获得结果的时间。

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06、实时统计

在需要时提供正确的统计信息

今天的研究人员需要尽可能快速、轻松地访问统计数据和数据结果。虽然 % Gated 和 MFI 等标准统计数据很重要,但研究人员通常依靠流量分析软件之外的多个软件包来在电子表格和其他绘图工具中执行从简单到复杂的计算。

FCS Express 包含您所期望的所有标准描述性统计数据,并增加了直接在软件中使用电子表格的能力。

在需要时提供正确的统计信息.png

07、扩散分析

FCS Express使用复杂的拟合过程来快速获得结果

用于评估细胞增殖活性的流式细胞术测定通常用于监测细胞的健康和生长速率。在这种类型的测定中,细胞示踪染料(例如 CFSE)被掺入细胞中。

随着每一轮细胞分裂,染料的相对荧光强度降低一半。其他软件包提供有限的数据建模功能或要求您完全使用单独的软件包。

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08、细胞周期分析

使用Multicycle进行集成流式细胞术细胞周期分析

通常在尝试分析流式细胞术DNA直方图以进行细胞周期或DNA分析时,在直方图上使用简单的区域标记是不够的。特别是如果DNA直方图显示大量来自不良样品制备的碎片和/或在同一直方图中存在多个DNA含量不同的DNA群体。

当这些情况出现时,需要使用强大的数学模型来去除碎片成分,并对直方图中的多个峰值进行反卷积。

细胞周期分析.png

09、高维数据缩减

直接集成、可访问且易于使用的领先细胞计数算法

随着新仪器和试剂的出现,获取高度多参数的流式细胞术数据集变得越来越常规,但将信息提炼成易于评估和报告的可视化仍然存在挑战。已经开发了tSNE、UMAP、FlowSOM、SPADE、kMeans、主成分分析 (PCA) 等形式的数据转换算法来帮助满足这些需求。

FCS Express允许研究人员轻松访问和使用这些工具,而无需依赖复杂的脚本或插件,它集成了具有拖放功能的直观界面。

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10、管道

为您的分析构建正确的工具

今天的研究人员在寻求最新的方法来准备和分析他们的数据时,经常会遇到算法黑匣子和复杂的编程要求。

FCS Express 通过 Pipelines 为您的数据的个性化需求提供量身定制的解决方案。跳过复杂的脚本,停止使用 R,或者担心编程。使用 Pipelines,您可以直接在 FCS Express 中定制每种算法以满足您的需求 - 无需插件。

 

 

三、FCS Express CE(临床版)功能

De Novo Software被FDA列为医疗设备制造商。FCS Express临床版是第一款在FDA上市的第三方流式细胞仪数据分析软件。

01、统计分类标记

统计分类器标记允许您根据文本对统计信息进行分类。

例如,您可以使用统计分类器标记根据峰值的中值将峰值的强度表征为Dim、Mid或Bright 。

统计分类代币.gif

02、警报功能

警报用于在满足条件时通知用户。它通常用于质量控制目的。  

您可以定义无限数量的警报。

创建警报后,您可以运行它们,并且 将显示满足您的条件的任何警报。

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03、Canned Comments

Canned Comments允许您创建一个预定义的评论库,可以在您的 FCS Express 布局中常规使用。

Canned Comments可以包含纯文本、动态文本(例如令牌)或两者兼有。

Canned Comments可以根据您的需要简单或详细。

04、条件字体格式

条件字体格式允许令牌的字体属性根据该令牌的值动态更改。

05、条件批处理

条件批处理允许您根据分析中的条件确定在批处理期间导出数据的格式。

06、条件页面可见性

条件页面可见性允许您根据分析中的现有条件确定 FCS Express 中页面的可见性。

 

 

四、关于FCS Express 7

FCS Express 7是De Novo Software与世界各地科学家密切合作的成果。第7版基于20多年的流式和图像细胞仪数据分析经验。客户要求新的实验可视化、提取高度多参数数据集的更简单方法、更快的速度以及许多其他改进,以帮助获得结果。

 

  • Phenograph和Lovuain社区

  • ThermoFisher .TMO文件兼容性

  • Fluidigm CytofXT的仪器特定设置

  • 新的统计命名选项

  • 能够在视图/导航器中显示/隐藏大门

  • NxN、KNN、Heatmaps、tSNE和unmixing的速度改进

  • 整体速度提升

  • 审计跟踪的改进

  • 为安全系统增加了密码复杂性要求

  • 热图的按参数多图选项颜色

  • 额外的门层次结构展开和折叠选项

  • 带有最近使用的关键字的关键字下拉对话框

 

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